祭神は海洋の神である、底津綿津見神・仲津綿津見神・表津綿津見神。この地は海人を統率した古代の有力氏族･阿曇氏発祥の地。神社内の万葉歌碑にも詠まれたように、古来より海上の守護神として崇拝されてきた。神社には国指定重要文化財の朝鮮製鍍金鐘、県指定文化財の細形銅剣鋳型を所蔵し、境内には石造宝篋印塔がある。また、歩射祭、山誉祭、神幸神事は、県の無形民俗文化財に指定されている。